9 Pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza (N = 1587)

9.1 Microrganismi isolati in pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza

Nella seguente tabella vengono considerate tutte le infezioni, ad esclusione dell’influenza A/H1N1 e del Covid-19.
Infezioni con Microrganismi isolati
N %
No 503 12.9
3384 87.1
Missing 11
Totale infezioni 3898
Totale microrganismi isolati 4399

Nel seguente grafico e nella seguente tabella vengono riportati tutti i microrganismi isolati per questa categoria di pazienti.
La percentuale riportata in tabella è calcolata sul totale di infezioni con microrganismi isolati.
Vengono mostrati fino ad un massimo di 30 microrganismi.

Microrganismo N % su isolati N con antibiogramma N MDR % MDR
Gram +
Staphylococcus aureus 209 11.0 171 46 26.9
Staphylococcus capitis 21 1.1 0 0 0
Staphylococcus CoNS altra specie 10 0.5 0 0 0
Staphylococcus haemolyticus 37 1.9 30 24 80
Staphylococcus hominis 44 2.3 0 0 0
Staphylococcus lugdunensis 3 0.2 0 0 0
Staphylococcus epidermidis 126 6.6 0 0 0
Streptococcus agalactiae 2 0.1 0 0 0
Streptococcus pneumoniae 13 0.7 10 2 20
Streptococcus altra specie 12 0.6 9 0 0
Enterococco faecalis 132 6.9 108 3 2.8
Enterococco faecium 123 6.5 104 41 39.4
Enterococco altra specie 9 0.5 6 1 16.7
Clostridium difficile 19 1.0 0 0 0
Clostridium altra specie 3 0.2 0 0 0
Totale Gram + 763 40.1 438 117 26.7
Gram -
Klebsiella pneumoniae 290 15.2 207 60 29
Klebsiella altra specie 82 4.3 66 5 7.6
Enterobacter spp 112 5.9 90 10 11.1
Altro enterobacterales 20 1.1 11 0 0
Serratia 74 3.9 59 0 0
Pseudomonas aeruginosa 353 18.6 301 99 32.9
Pseudomonas altra specie 9 0.5 8 3 37.5
Escherichia coli 220 11.6 178 4 2.2
Proteus 58 3.0 45 3 6.7
Acinetobacter 149 7.8 108 92 85.2
Emofilo 12 0.6 0 0 0
Citrobacter 38 2.0 29 2 6.9
Morganella 16 0.8 12 0 0
Providencia 2 0.1 0 0 0
Altro gram negativo 19 1.0 0 0 0
Totale Gram - 1454 76.4 1114 278 25
Funghi
Candida albicans 166 8.7 0 0 0
Candida glabrata 50 2.6 0 0 0
Candida krusei 2 0.1 0 0 0
Candida parapsilosis 73 3.8 0 0 0
Candida tropicalis 17 0.9 0 0 0
Candida specie non determinata 5 0.3 0 0 0
Candida altra specie 14 0.7 0 0 0
Aspergillo 77 4.0 0 0 0
Pneumocistie Jirovecii 3 0.2 0 0 0
Funghi altra specie 30 1.6 0 0 0
Totale Funghi 437 23.0 0 0 0
Virus
Citomegalovirus 26 1.4
Herpes simplex 11 0.6
Altro Virus 8 0.4
Totale Virus 45 2.4 0 0 0
Altri Microrganismo
Mycobacterium tuberculosis 1 0.1 0 0 0
Totale Altri Microrganismi 1 0.1 0 0 0

Nel seguente grafico sono riportati i microrganismi che possono sviluppare resistenze: in rosso i germi resistenti, in verde quelli sensibili e in grigio quelli per cui non è possibile risalire all’informazione.
Vengono mostrati fino ad un massimo di 25 microrganismi.Nel grafico e nella tabella precedenti non sono stati riportati i germi che non sono stati isolati ( Pyogens, Clamidia, Legionella, Candida auris, Influenza A, Influenza AH3N2, Influenza altro A, Influenza B, Influenza tipo non specificato, Mycoplasma, Mycobacterium altra specie ).
Per la definizione di MDR si veda la sezione Definizione di MDR.

9.1.1 Raggruppamento dei microrganismi isolati nei pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza

Per ulteriori informazioni riguardanti il criterio di raggruppamento eseguito si veda la sezione Raggruppamento microrganismi.

Microrganismo N N con antibiogramma N sensibili N MDR % MDR N missing
Cons 37 30 6 24 80.00 7
Enterococco 264 218 173 45 20.64 46
Escpm 148 116 113 3 2.59 32
Klebsiella 372 273 208 65 23.81 99
Pseudomonas 362 309 207 102 33.01 53
Streptococco 12 9 9 0 0.00 3

9.1.2 Resistenze antibiotiche di microrganismi responsabili MDR isolati nei pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza

Nella tabella seguente sono riportate le resistenze agli antibiotici che sono state individuate.
Per l’elenco completo delle resistenze che vengono testate si veda la sezione Definizione di MDR.
Microrganismo N Resistenza N resistenza %
Klebsiella pneumoniae 295 Ertapenem 69 23.39
Klebsiella pneumoniae 297 Meropenem 81 27.27
Klebsiella altra specie 89 Ertapenem 5 5.62
Klebsiella altra specie 91 Meropenem 2 2.20
Citrobacter 34 Ertapenem 2 5.88
Citrobacter 34 Meropenem 3 8.82
Enterobacter spp 118 Ertapenem 9 7.63
Enterobacter spp 119 Meropenem 7 5.88
Escherichia coli 323 Ertapenem 6 1.86
Escherichia coli 325 Meropenem 5 1.54
Proteus 64 Ertapenem 4 6.25
Proteus 65 Meropenem 4 6.15
Serratia 76 Ertapenem 1 1.32
Serratia 75 Meropenem 1 1.33
Acinetobacter 127 Imipenem 84 66.14
Acinetobacter 130 Meropenem 110 84.62
Pseudomonas aeruginosa 375 Imipenem 106 28.27
Pseudomonas aeruginosa 380 Meropenem 74 19.47
Pseudomonas altra specie 8 Imipenem 2 25.00
Pseudomonas altra specie 8 Meropenem 2 25.00
Staphylococcus haemolyticus 42 Meticillina 30 71.43
Staphylococcus aureus 308 Meticillina 75 24.35
Streptococcus pneumoniae 47 Penicillina 6 12.77
Enterococco faecalis 149 Vancomicina 3 2.01
Enterococco faecium 143 Vancomicina 54 37.76
Enterococco altra specie 10 Vancomicina 1 10.00

9.1.3 Meccanismi di resistenza genotipica per gli Enterobacterales isolati nei pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza

Nelle tabelle seguenti viene mostrato se sono stati effettuati dei test di resistenza genotipica e gli eventuali meccanismi di resistenza individuati. É sufficiente che un microrganismo sia resistente/non testato secondo un meccanismo affinchè venga considerato resistente/non testato. Per risultare negativo dovrà quindi essere negativo per tutti i test.
La seconda tabella fa invece riferimento alla singola resistenza microrganismo-meccanismo di resistenza. La percentuale di resistenza viene calcolata sul totale dei genotipi resistenti.
N %
112 8.12
No 245 17.77
Non testato 1022 74.11
Missing 1096
Meccanismo Resistente % resistente Sensibile Non testato
imp 12 7.4 332 1071
kpc 93 57.1 289 1045
ndm 23 14.1 330 1067
oxa 18 11.0 331 1068
vim 17 10.4 327 1071