9 Pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza (N = 805)

9.1 Microrganismi isolati in pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza

Nella seguente tabella vengono considerate tutte le infezioni.
Infezioni con Microrganismi isolati
N %
No 294 15.1
1652 84.9
Missing 17
Totale infezioni 1963
Totale microrganismi isolati 2188

Nel seguente grafico e nella seguente tabella vengono riportati tutti i microrganismi isolati per questa categoria di pazienti.
La percentuale riportata in tabella è calcolata sul totale di infezioni con microrganismi isolati (“% su inf. con isolati”).
Le percentuali riferite al totale dei diversi raggruppamenti di microrganismi rappresentano il rapporto tra il numero di infezioni in cui è stato isolato almeno un microrganismo appartenente al rispettivo raggruppamento e il totale delle infezioni con microrganismi isolati (“% su inf. con isolati”).
Vengono mostrati fino ad un massimo di 30 microrganismi.

Microrganismo N % su inf. con isolati N con antibiogramma N MDR % MDR
Gram +
Staphylococcus aureus 165 10.0 108 35 32.4
Staphylococcus capitis 12 0.7 6 4 66.7
Staphylococcus CoNS altra specie 12 0.7 6 3 50
Staphylococcus haemolyticus 25 1.5 18 14 77.8
Staphylococcus hominis 28 1.7 17 10 58.8
Staphylococcus lugdunensis 5 0.3 1 0 0
Staphylococcus epidermidis 68 4.1 47 35 74.5
Pyogenes 8 0.5 6 1 16.7
Streptococcus agalactiae 8 0.5 5 0 0
Streptococcus pneumoniae 46 2.8 30 3 10
Streptococcus altra specie 24 1.5 14 3 21.4
Enterococco faecalis 82 5.0 68 9 13.2
Enterococco faecium 86 5.2 69 31 44.9
Enterococco altra specie 4 0.2 0 0 0
Clostridium difficile 27 1.6
Clostridium altra specie 10 0.6
Totale Gram + 565 34.2 395 148 37.5
Gram -
Klebsiella pneumoniae 218 13.2 161 55 34.2
Klebsiella altra specie 57 3.5 41 4 9.8
Enterobacter spp 87 5.3 58 5 8.6
Altro enterobacterales 18 1.1 5 2 40
Serratia 49 3.0 37 1 2.7
Pseudomonas aeruginosa 244 14.8 189 47 24.9
Pseudomonas altra specie 3 0.2 2 0 0
Escherichia coli 230 13.9 173 5 2.9
Proteus 26 1.6 16 0 0
Acinetobacter 48 2.9 32 26 81.2
Emofilo 38 2.3
Legionella 23 1.4
Citrobacter 28 1.7 23 0 0
Morganella 9 0.5 6 3 50
Providencia 3 0.2 1 0 0
Clamidia 6 0.4
Altro gram negativo 32 1.9
Stenotrophomonas 52 3.1 37 6 16.2
Totale Gram - 980 59.3 781 154 19.7
Funghi
Candida albicans 104 6.3 40 5 12.5
Candida glabrata 42 2.5 17 8 47.1
Candida krusei 13 0.8 3 2 66.7
Candida parapsilosis 26 1.6 15 5 33.3
Candida tropicalis 12 0.7 7 2 28.6
Candida specie non determinata 2 0.1 0 0 0
Candida altra specie 10 0.6 6 4 66.7
Aspergillo 37 2.2
Pneumocistie Jirovecii 6 0.4
Funghi altra specie 24 1.5
Totale Funghi 255 15.4 88 26 29.5
Virus
Coronavirus 12 0.7
Influenza A 17 1.0
Influenza AH1N1 17 1.0
Influenza AH3N2 1 0.1
Influenza B 4 0.2
Influenza tipo non specificato 1 0.1
Citomegalovirus 14 0.8
Herpes simplex 19 1.2
Altro Virus 29 1.8
Totale Virus 112 6.8
Altri Microrganismo
Mycoplasma 12 0.7
Mycobacterium tuberculosis 4 0.2
Mycobacterium altra specie 1 0.1
Totale Altri Microrganismi 17 1.0

Nel seguente grafico sono riportati i microrganismi che possono sviluppare resistenze: in rosso i germi resistenti, in verde quelli sensibili e in grigio quelli per cui non è possibile risalire all’informazione.
Vengono mostrati fino ad un massimo di 20 microrganismi.Nel grafico e nella tabella precedenti non sono stati riportati i germi che non sono stati isolati ( Candida auris, Influenza altro A ).
Per la definizione di MDR si veda la sezione Definizione di MDR.

9.1.1 Raggruppamento dei microrganismi isolati nei pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza

Microrganismo N N con antibiogramma N sensibili N MDR % MDR N missing
Candida 209 88 62 26 29.5 121
Cons 150 95 29 66 69.5 55
Enterococco 172 137 97 40 29.2 35
Escpm 176 125 116 9 7.2 51
Klebsiella 275 202 143 59 29.2 73
Pseudomonas 247 191 144 47 24.6 56
Streptococco 86 55 48 7 12.7 31

Per ulteriori informazioni riguardanti il criterio di raggruppamento eseguito si veda la sezione Raggruppamento microrganismi.

9.1.2 Resistenze antibiotiche di microrganismi responsabili MDR isolati nei pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza

Nella tabella seguente sono riportate le resistenze agli antibiotici che sono state individuate.
Per l’elenco completo delle resistenze che vengono testate si veda la sezione Definizione di MDR.
Microrganismo N Resistenza N resistenza %
Escherichia coli 151 Ertapenem 5 3.3
Escherichia coli 171 Meropenem 1 0.6
Klebsiella pneumoniae 123 Ertapenem 43 35.0
Klebsiella pneumoniae 161 Meropenem 50 31.1
Klebsiella altra specie 33 Ertapenem 4 12.1
Klebsiella altra specie 41 Meropenem 3 7.3
Enterobacter spp 48 Ertapenem 5 10.4
Enterobacter spp 57 Meropenem 2 3.5
Serratia 29 Ertapenem 1 3.4
Serratia 37 Meropenem 1 2.7
Morganella 5 Ertapenem 2 40.0
Morganella 6 Meropenem 1 16.7
Altro enterobacterales 4 Ertapenem 1 25.0
Altro enterobacterales 5 Meropenem 1 20.0
Acinetobacter 30 Imipenem 24 80.0
Acinetobacter 32 Meropenem 26 81.2
Pseudomonas aeruginosa 156 Imipenem 39 25.0
Pseudomonas aeruginosa 187 Meropenem 34 18.2
Staphylococcus aureus 108 Meticillina 35 32.4
Staphylococcus epidermidis 47 Meticillina 35 74.5
Staphylococcus haemolyticus 18 Meticillina 14 77.8
Staphylococcus hominis 17 Meticillina 10 58.8
Staphylococcus capitis 6 Meticillina 4 66.7
Staphylococcus CoNS altra specie 6 Meticillina 3 50.0
Streptococcus pneumoniae 30 Penicillina 3 10.0
Pyogenes 6 Penicillina 1 16.7
Streptococcus altra specie 14 Penicillina 3 21.4
Enterococco faecalis 68 Vancomicina 9 13.2
Enterococco faecium 69 Vancomicina 31 44.9
Candida albicans 40 Fluconazolo 5 12.5
Candida glabrata 17 Fluconazolo 8 47.1
Candida krusei 3 Fluconazolo 2 66.7
Candida parapsilosis 15 Fluconazolo 5 33.3
Candida tropicalis 7 Fluconazolo 2 28.6
Candida altra specie 6 Fluconazolo 4 66.7
Stenotrophomonas 37 Cotrimossazolo 6 16.2

9.1.3 Meccanismi di resistenza genotipica per gli Enterobacterales isolati nei pazienti infetti sia all’ammissione che in degenza

Nelle tabelle seguenti viene mostrato se sono stati effettuati dei test di resistenza genotipica e gli eventuali meccanismi di resistenza individuati. È sufficiente che un microrganismo sia resistente/non testato secondo un meccanismo affinché venga considerato resistente/non testato. Per risultare negativo dovrà quindi essere negativo per tutti i test.
La seconda tabella fa invece riferimento alla singola resistenza microrganismo-meccanismo di resistenza. La percentuale di resistenza viene calcolata sul totale dei genotipi resistenti.
N %
42 10.7
No 88 22.3
Non testato 264 67
Missing 331
Meccanismo Resistente % resistente Sensibile Non testato
imp 5 8.1 115 268
kpc 22 35.5 110 259
ndm 23 37.1 102 267
oxa 7 11.3 114 267
vim 5 8.1 115 268